第六季开篇，原分子病毒星门网络突然崩溃，连接数千个星系的门户同时关闭。每一颗殖民星球都成了孤岛，无法通讯，无法支援。罗西南特号的船员们被困在一个陌生星系，资源仅够维持三个月。更糟的是，这个星系存在一个原生智慧物种，它们把人类视为入侵者。同时在地球、火星和贝尔特联盟，断联引发了全面的恐慌和内战。霍顿必须在本季中找到重启星门的方法，而线索藏在原分子病毒的创造者留下的遗迹中。但他面临一个残酷选择：重启星门会让所有被封锁的星系重新连接，但也会唤醒沉睡的星门创造者——一个曾毁灭过无数文明的古老敌人。
星门网络全面崩溃，人类被困在数千个孤独的星系中。
最终季保持了一贯的高水准。格局大开，从人类内斗上升到宇宙级危机。每一帧都是经费燃烧，太空战设计依然顶级。完美收官，意难平但也无憾。
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